MŽP/ Program EMAS byl v České republice ustanoven na základě Usnesení vlády ČR č. 466/1998 o schválení Národního programu zavedení systému řízení podniků a auditu z hlediska ochrany životního prostředí a aktualizován Usnesením vlády ČR č. 651/2002 (doc, 39 kB) o aktualizaci Národního programu zavedení systému řízení podniků a auditu z hlediska ochrany životního prostředí (Aktualizovaný program EMAS).
Na základě usnesení byly vydány dva základní dokumenty, které vytváří rámec pro fungování Programu EMAS v ČR. Jedná se oNárodní program zavedení systému řízení podniků a auditu z hlediska ochrany životního prostředí (Aktualizovaný program EMAS(doc, 109 kB) - popisuje základní souvislosti environmentálního řízení a úlohu jednotlivých zúčastněných subjektů v rámci Programu EMAS;
Pravidla k zavedení systému řízení podniků a auditu z hlediska ochrany životního prostředí (Aktualizovaná pravidla (doc, 284 kB) - obsahují konkrétní práva a povinnosti zúčastněných subjektů (organizací), environmentálních ověřovatelů, akreditačního orgánu a státu (správních úřadů).
Vzhledem ke vstupu České republiky do Evropské unie a z toho vyplývající plné aplikovatelnosti a platnosti Nařízení č. 761/2001 (doc, 241 kB) se Program EMAS v ČR řídí od 1. května 2004 primárně zmíněným nařízením. Z Aktualizovaných pravidel EMAS zůstávají v platnosti ta ustanovení, ve kterých ponechává nařízení členským státům volnost k individuální úpravě. Jedná se např. o organizační zabezpečení programu, otázku akreditace environmentálních ověřovatelů, finanční a jiné podpory apod.